Tańsze części zamienne są często wykonane z gorszych materiałów oraz charakteryzują się krótszym czasem eksploatacji. Słabszy materiał filtrujący zmniejsza również efektywność filtra, umożliwiając przedostawanie się cząstek do układu pneumatycznego. Elementy filtrów, które nie są wykonane ze stali nierdzewnej mogą ulegać korozji oraz awarii podczas pracy.
Nawet jeśli alternatywny wkład pasuje do urządzenia, to nie został on zaprojektowany specjalnie do filtrów Atlas Copco, dlatego nie będzie do nich pasować w 100%. Może to powodować większy spadek ciśnienia oraz większe zużycie energii, a także większe koszty całkowite związane z eksploatacją instalacji sprężonego powietrza.